12月3日组会文章笔记

分享一些组会/论文笔记,推荐几篇进化生物学/群体遗传学/基因组学的文章。才疏学浅的我只推荐,就不深入解读了:D

ps. 欢迎点进链接查看论文页面,欢迎留言。(感觉初期还不好意思把这个推荐给同学,估计看得人还比较少,暂且自己留个笔记于此。)

Rapid hybrid speciation in Darwin’s finches

达尔文雀中的快速杂交物种形成 文章链接

11月23日发在Science上的文章,一对研究达尔文雀几十年的老夫妇的最新研究。讲了他们之前发现的一个个体(图中G500)迁移到一座岛上,与岛上另一个达尔文雀物种(G. fortis)产生后代,接连观察并绘制了六代的谱系图。并对其中一些个体取样测序分析,辅以形态学数据,最终报道了这只迁移个体通过与当地达尔文雀繁殖,仅在三代之内即可以产生生殖隔离的例子。而一般情况下的生殖隔离的产生通常会经历几百代。

补充判断杂交形成新物种要看的三个依据:物种、生殖隔离和生态位。文中关于形态学上个体间差异之处有喙的长度、叫声等,叫声不同可能对于产生生殖隔离有影响(交流障碍导致的惨案…)。

Evolutionary genomics of grape (Vitis vinifera ssp. vinifera) domestication

葡萄驯化的进化基因组学 文章链接

10月31日发在PNAS上的文章,第一作者是刘老师以前的学生,老师借此感叹一番,督促我们认真学习。物种漫长驯化过程中,基因组层面的展现的历史也是很有意思的,而且葡萄对我们现在的生活也挺重要。

文章分析使用的软件我还得补充一些背景知识。

The draft genome of tropical fruit durian (Durio zibethinus)

热带水果榴莲的基因组草图 文章链接

10月9日在线发在 nature genetics上,发表了榴莲基因组,分析了榴莲独特气味的来源,真是一篇有味道的文章。

The impact of missing data on species tree estimation

缺失数据对于物种树估计的影响 文章链接

15年11月的文章,一作是一位我认识的老师,缺失数据对于物种树估计的影响,是个感兴趣的话题。


论文是读不完的,感兴趣的话倒是可以先了解一下。